Από τις οικείες διατάξεις του ΚΦΔ συνάγεται ότι το αίτημα για τροποποίηση φορολογικής δήλωσης (ειδικότερα όταν εμπεριέχεται αίτημα ανάκλησης) και η συνακόλουθη αναζήτηση του αχρεωστήτως καταβληθέντος φόρου αποτελεί διακριτή διαδικασία που δεν κωλύεται από την υποβολή της σχετικής δήλωσης με επιφύλαξη και την τυχόν ρητή ή σιωπηρή απόρριψη αυτής, δεδομένου ότι η επιφύλαξη συνδέεται αρρήκτως με τη δήλωση και, συνεπώς, με την ανάκληση ανατρέπεται τόσο η δήλωση όσο και η συνοδεύουσα αυτήν επιφύλαξη. Για τον ίδιο δε λόγο, ούτε και η άπρακτη πάροδος της προθεσμίας άσκησης ενδικοφανούς προσφυγής και συνακόλουθα δικαστικής προσφυγής κατά της ρητής ή σιωπηρής απόρριψης της επιφύλαξης καθιστά οριστική και αμετάκλητη την οικεία φορολογική εγγραφή, ώστε να είναι ανεπίτρεπτη η τροποποίηση της δήλωσης κατά τις ανωτέρω διατάξεις, παρά μόνο στην περίπτωση που υπάρχει δεδικασμένο επί της ουσίας.
Το Δικαστήριο, λαμβάνοντας υπόψη ότι η τροποποιητική δήλωση της προσφεύγουσας υπεβλήθη εντός του χρονικού διαστήματος για έλεγχο της αρχικής δήλωσης φορολογικού έτους 2015, καθώς επίσης ότι δεν υφίστατο δεδικασμένο επί της ουσίας της διαφοράς, η αναζήτηση του αχρεωστήτως καταβληθέντος φόρου με την υποβολή τροποποιητικής δήλωσης δεν κωλύετο, όπως αβασίμως υποστηρίζει το Δημόσιο, ούτε από την υποβολή της αρχικής δήλωσης στην οποία τέθηκε επιφύλαξη, ούτε από την άπρακτη πάροδο της προθεσμίας άσκησης προσφυγής επί της απόφασης του Προϊσταμένου της ΔΕΔ, απορριπτικής της ενδικοφανούς προσφυγής κατά της σιωπηρής απόρριψης της επιφύλαξης από τον Προϊστάμενο της Δ.Ο.Υ.
Ενόψει των ανωτέρω, το Δικαστήριο κρίνει ότι η αιτιολογική βάση της απόρριψης της ενδικοφανούς προσφυγής της προσφεύγουσας κατά της τεκμαιρόμενης απόρριψης από τον Προϊστάμενο της Δ.Ο.Υ. της τροποποιητικής δήλωσης - μερικής ανάκλησης φορολογίας εισοδήματος φορολογικού έτους 2015, ως έχουσα σχέση με φορολογική εγγραφή που έχει ήδη οριστικοποιηθεί, δεν είναι νόμιμη και η ενδικοφανής προσφυγή της προσφεύγουσας είχε ασκηθεί παραδεκτώς.
Αναπέμπει την υπόθεση στη ΔΕΔ της Α.Α.Δ.Ε., προκειμένου να εξεταστεί κατ’ ουσίαν η ενδικοφανής προσφυγή.